수산학연구원은 어류 및 어구, 수산업 관련 시설 등을 연구하며, 세부적으로 연구대상에 따른 주제를 선정해 연구를 수행한다. 연구과정에서는 문헌조사나 사례조사를 통해연구·개발 계획을 수립하며 모형을 설계·제작하고 수리모형을 통해 실험을 하게 된다. 연구소 내 또는 바다에서 화류수조, 수중카메라 등을 설치·조립하고 장력계, 저항동력계, 6자 유도계 등을 사용하여 실험하고 분석하기도 한다. 그 외에도 일반 연구원이 수행하는 일반적인 연구기획 및 과제수행 관리 등의 업무를 수행한다.
수산학연구원이 되기 위해서는 대학교에서 해양 및 수산학 관련 석사 이상의 학위를 취득해야 한다. 국가기관에서 채용할 경우는 자격증 등급별로 가산점이 부여되고, 경우에 따라서는 응시자격을 자격증 소지자로 제한하는 경우도 있다. 수산학연구원은 주로 국가기관에서 운영하는 연구소에서 근무한다. 수산학연구원이면서 어촌지도사로 활동할 수도 있는데, 어촌지도사는 지도직공무원으로 국립수산과학원, 각 지역 수산관리소, 어업기술센터 등에서 근무하게 된다. 어촌지도사로 근무하려면 먼저 국가공무원시험에 응시해야 한다. 공무원 채용은 공개채용과 특별채용으로 나뉘며 채용은 응시지역 및 분야에 따라 차이가 있으므로 반드시 응시하고자 하는 지역의 공고를 확인해야 한다.