인지인문학은 인문학의 다양한 통섭을 통해 실천적 정립에 그 목적을 두고 있기 때문에 단순히 ‘두뇌에 의한 정신활동’이나 ‘신체의 인지기능’에 대한 형이상학적 · 추상적 논리를 추구하지 않는다. 인지인문학은 자연과학의 경험적이고 구체적인 종래의 논리를 보완하여 인지과학의 학제적 영역으로 확장을 통해 규명해 나가야 할 과제를 갖고 있다. 인지인문학은 주체와 객체, 정신과 물질[몸]의 이분법을 해체하며 〈마음=몸+뇌+환경〉 이라는 등식을 따르는 방법론을 취한다.
향후 인지인문학은 뇌 과학과 연계하여 〈인지문화 혹은 마음의 과학〉의 인식론적 토대를 정립하여 실천적 토대를 구축해야 하는 과제를 여전히 안고 있다. 따라서 인간의 문화는 마음과 몸, 인간과 인간 사이, 인간과 사물, 나아가 사물과 사물 사이에서 ‘동시적으로 편재’하며 상호 소통하는 사이[네트워크]의 공간(유비쿼터스 공간)에서 창출되는 ‘인간의 자기 활동적 산물’을 지속해 나갈 것이다.